O processo seletivo para os níveis de mestrado, doutorado e mestrado profissional ocorrem mediante publicação de edital no primeiro semestre de cada ano.

Para o mestrado acadêmico o processo envolve análise de currículo, prova sobre tema geral em Odontologia, prova de tema específico à área de concentração do candidato e arguição sobre projeto de pesquisa, além de prova de língua estrangeira. A seleção para o nível de doutorado inclui a avaliação do currículo, apresentação oral seguida de arguição de projeto de pesquisa,

Para o mestrado profissional em Odontologia em Saúde Pública, além da avaliação de currículo, o candidato submete-se à prova sobre tema específico à área e à arguição de projeto de pesquisa.

Mais informações podem ser obtidas nos editais disponibilizados no site anualmente.